qPCR實(shí)驗(yàn)操作與數(shù)據(jù)分析指南
一、實(shí)驗(yàn)操作流程
樣品準(zhǔn)備
RNA提取:使用Trizol法裂解樣本,加入異丙醇沉淀RNA,75%洗滌后溶解于無(wú)酶水中。
反轉(zhuǎn)錄:將RNA與逆轉(zhuǎn)錄酶混合,37℃孵育15分鐘,85℃滅活5秒。
qPCR體系配制
預(yù)混液配置:將SYBRGreen染料、引物和無(wú)酶水按比例混合,避免反復(fù)凍融。
加樣技巧:每樣本設(shè)3個(gè)重復(fù)孔,使用預(yù)混液減少誤差,槍頭需更換以防交叉污染。
上機(jī)運(yùn)行
離心除氣泡:上機(jī)前短暫離心,輕彈管壁消除氣泡。
程序設(shè)置:采用三步法(變性、退火、延伸),熔解曲線驗(yàn)證引物特異性。
二、數(shù)據(jù)分析方法
數(shù)據(jù)預(yù)處理
Ct值計(jì)算:記錄熒光信號(hào)達(dá)到閾值的循環(huán)數(shù),內(nèi)參基因(如GAPDH)用于標(biāo)準(zhǔn)化。
△Ct值:目的基因Ct值減去內(nèi)參基因Ct值,消除樣本間差異。
相對(duì)定量計(jì)算
法:實(shí)驗(yàn)組△Ct值減去對(duì)照組△Ct值,計(jì)算相對(duì)表達(dá)量。
示例公式:若實(shí)驗(yàn)組△Ct為4.43,對(duì)照組為3.21,則表達(dá)量為2^(4.43-3.21)=2^1.22≈2.28倍。
結(jié)果可視化
圖表繪制:使用GraphPadPrism繪制柱狀圖,橫坐標(biāo)為樣本組別,縱坐標(biāo)為相對(duì)表達(dá)量。
三、常見問題與優(yōu)化
引物設(shè)計(jì):擴(kuò)增子長(zhǎng)度建議80-200bp,避免二聚體形成。
陰性對(duì)照:用水替代模板,若出現(xiàn)擴(kuò)增信號(hào)需檢查引物特異性。
重復(fù)性差:預(yù)混液分裝后加樣,減少操作誤差。
提示:實(shí)驗(yàn)前需驗(yàn)證引物擴(kuò)增效率,數(shù)據(jù)需包含至少3個(gè)重復(fù)孔以提高可靠性。
注:以上僅供參考,不作為實(shí)際數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)需嚴(yán)格遵循說(shuō)明或咨詢技術(shù)老師。Elisa試劑盒
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